A Polícia Federal (PF) inicialmente defendeu a permanência dos delegados Daniel Cola e Wedson Cajé em funções de chefia, uma semana antes de determinar o afastamento deles, alegando reestruturação administrativa. O pedido foi formalizado em um ofício, datado de 29 de outubro, encaminhado ao Ministério da Justiça e assinado pelo diretor-executivo da PF, William Murad. O ofício continha uma minuta referendando as nomeações pelo diretor-geral da PF, Andrei Rodrigues.
O afastamento dos delegados ocorreu após a entrega de relatórios abordando as condutas dos ministros do Supremo Tribunal Federal (STF) Kassio Nunes Marques, Alexandre de Moraes e Dias Toffoli, gerando desconforto na cúpula da corporação. Os documentos foram elaborados por determinação do presidente do STF, Edson Fachin, com o propósito de subsidiar possíveis pedidos de investigação sobre magistrados.
Após a entrega dos relatórios no dia 3 de novembro, Cola e Cajé foram informados de que perderiam seus cargos de chefia dois dias depois. A PF argumenta que as mudanças de liderança dentro da corporação são decisões administrativas e não impactam as investigações em andamento. Entretanto, houve críticas internas sobre a elaboração dos relatórios, com alegações de que os delegados teriam extrapolado as diretrizes estabelecidas por Fachin.
Os delegados afastados estavam envolvidos em uma nova estrutura da PF, que incluía uma reestruturação administrativa do Ministério da Justiça. Cola, por exemplo, havia sido indicado para permanecer na coordenação-geral de Repressão à Corrupção e Crimes Financeiros, enquanto Cajé seria destacado para uma coordenação na mesma área, antes do afastamento.
A mudança de liderança na PF ocorre em um cenário de tensões relacionadas ao governo de Luiz Inácio Lula da Silva, especialmente em um contexto onde aliados do presidente indicam que a permanência de Andrei pode estar em risco. O presidente da Associação dos Delegados da Polícia Federal, Edvandir Felix de Paiva, criticou os afastamentos e a decisão de refazer os relatórios, argumentando que a direção da PF não deveria interferir no conteúdo do material produzido pelos delegados.
Em meio a essa crise, o ministro Gilmar Mendes expressou apoio ao diretor-geral Andrei Rodrigues, ressaltando a necessidade de preservar a autonomia da PF e permitindo sua capacidade de realizar mudanças administrativas de acordo com o interesse público.